Dr.Dong Xu gave a speech on 5th TianJuan Youth seminar
2015年12月3日,董旭博士应邀作为青年学者在我所第五届天眷青年波谱讲坛上做了报告。报告题目为化学交联质谱分析
在蛋白质动态结构研究中的应用。刘买利所长、李从刚研究员、邓风研究员等众多师生在“弛豫空间”认真听取了报告,并进行了热情的交流。
董旭博士介绍了传统的溶液蛋白质结构研究方法,NMR是传统溶液蛋白质结构研究方法,通过NMR相关距离约束进行蛋白
质结构计算。这一技术要求浓度较高的同位素标记的蛋白质、受到蛋白质分子量限制、超过100小时的采样时间、筛选分析上千个核磁共振信号。
而化学交联结合质谱鉴定技术(CXMS)是近年来发展起来的用于研究生物大分子相互作用的新方法。化学交联剂能够与赖氨酸上的基团反应,从而交联蛋白质表面上一定距离内的氨基酸,由此提供蛋白质上两点之间的距离信息。该方法对蛋白样品的量与纯度要求较低,实验周期较短,因而具备广泛的适用性。我们将该方法应用到了蛋白质动态学研究中。CXMS方法能够捕获溶液中蛋白质的动态结构,提供蛋白质结构域之间的动态信息。以经典的钙调蛋白CaM、谷氨酰胺结合蛋白(Glutamine Binding Protein ,QBP)、大肠杆菌N端酶I(The Nterminal of Enzyme I ,EIN)为例,利用CXMS方法获得了其动态结构。通过
该方法表征了CaM,QBP和EIN在溶液中结构域之间的运动,解析了它们出现频率低,存在时间短的构象。